| 建物名称 | 竣工年月日 | 総面積（㎡） | 使用専攻、プログラム、センター | 備考 |
|---|---|---|---|---|
| 生命棟 | 2001年3月 | 8,862 | 先端生命科学専攻、メディカル情報生命専攻、 生命データサイエンスセンター |
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| 基盤棟（Ⅰ期） | 2002年3月 | 9,048 | 物質系専攻、先端エネルギー工学専攻、 複雑理工学専攻、核融合研究教育プログラム、 基盤科学領域創成研究教育プログラム、 海洋技術環境学専攻 |
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| 基盤棟（Ⅱ期） | 2003年10月 | 8,358 | 物質系専攻、先端エネルギー工学専攻、 複雑理工学専攻、核融合研究教育プログラム、 基盤科学領域創成研究教育プログラム、 海洋技術環境学専攻 |
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| 基盤科学実験棟 | 2003年12月 | 5,630 | 物質系専攻、先端エネルギー工学専攻、 複雑理工学専攻、核融合研究教育プログラム |
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| 情報生命科学実験棟 | 2004年3月 | 1,056 | メディカル情報生命専攻、 生命データサイエンスセンター |
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| 総合研究棟 | 2004年10月 | 2,200 | メディカル情報生命専攻、 核融合研究教育プログラム |
総合研究棟総面積15,793㎡のうち2,200㎡を使用 |
| 環境棟 | 2006年3月 | 20,800 | 自然環境学専攻、
海洋技術環境学専攻、 環境システム学専攻、人間環境学専攻、 社会文化環境学専攻、国際協力学専攻、 サステイナビリティ学グローバルリーダー養成大学院プログラム |
2017（平成29）年度でPFI事業は終了 |
| 医科研2号館（白金台） | 1967年度 | 766 | メディカル情報生命専攻 | 借用スペース |
| 総合研究棟 | 2004年度 | 413 | メディカル情報生命専攻、物質系専攻、 先端エネルギー工学専攻 |
借用スペース |
| 第2総合研究棟 | 2011年度 | 1,464 | 物質系専攻 | 借用スペース |
| 産学官民連携棟（柏Ⅱ） | 2019年度 | 793 | メディカル情報生命専攻、 生命データサイエンスセンター、物質系専攻 |
借用スペース |
| 計 | 59,390 | |||
※2022年4月時点