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河村 正二 かわむら しょうじ/教授/生命科学研究系
先端生命科学専攻/機能生命科学講座/人類進化システム分野/感覚系遺伝子の進化生態遺伝学
http://www.jinrui.ib.k.u-tokyo.ac.jp/kawamura-home.html

略歴
1986年3月 東京大学理学部生物学科人類学課程卒業
1991年3月 東京大学大学院理学系研究科人類学専攻博士課程修了(理学博士)
1991年4月〜1992年7月 日本学術振興会特別研究員(PD)
1992年1月〜1996年8月米国シラキュース大学生物学専攻Shozo Yokoyama研究室ポストドクトラル研究員
1996年9月 東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻助手
1999年4月 東京大学大学院新領域創成科学研究科先端生命科学専攻助教授(2007年4月より准教授に改称)
2010年10月 現職
教育活動
大学院:適応進化遺伝学、生命科学英語特論、生命科学英語演習
研究活動
1.ヒト色覚多様性の起源とその進化学的成因
2.新世界ザルをモデルとした霊長類3色型色覚の進化学的意義の検討
3.魚類をモデルとした色覚進化の適応的柔軟性の検討
4.霊長類におけるケミカルセンスと視覚の共進化の検討
(詳しくは研究室ホームページを参照)
[文献]
*責任著者
<代表的原著論文>
(1) *Li, Y. N., Tsujimura, T., Kawamura, S. and Dowling, J. E. (2012). Bipolar cell–photoreceptor connectivity in the zebrafish (Danio rerio) retina. The Journal of Comparative Neurology, 520: 3786–3802.
(2) Hiwatashi, T., Mikami, A., Katsumura, T., Suryobroto, B., Perwitasari-Farajallah, D., Malaivijitnond, S., Siriaroonrat, B., Oota, H., Goto, S. and *Kawamura, S. (2011). Gene conversion and purifying selection shape nucleotide variation in gibbon L/M opsin genes. BMC Evolutionary Biology, 11: 312.
(3) Tsujimura, T., Hosoya, T. and *Kawamura, S. (2010). A single enhancer regulating the differential expression of duplicated red-sensitive opsin genes in zebrafish. PLoS Genetics, 6: e1001245.
(4) Hiwatashi, T., Okabe, Y., Tsutsui, T., Hiramatsu, C., Melin, A. D., Oota, H., Schaffner, C. M., Aureli, F., Fedigan, L. M., Innan, H. and *Kawamura, S. (2010). An explicit signature of balancing selection for color-vision variation in New World monkeys. Molecular Biology and Evolution, 27: 453-464.
(5) *Melin, A. D., Fedigan, L. M., Hiramatsu, C., Hiwatashi, T., Parr, N. and *Kawamura, S. (2009). Fig foraging by dichromatic and trichromatic white-faced capuchin monkeys in a tropical dry forest. International Journal of Primatology, 30: 753-775.
(6) Hiramatsu, C., Melin, A. D., Aureli, F., Schaffner, C. M., Vorobyev, M. and *Kawamura, S. (2009). Interplay of olfaction and vision in fruit foraging of spider monkeys. Animal Behaviour, 77: 1421-1426.
(7) Takechi, M., Seno, S. and *Kawamura, S. (2008). Identification of cis-acting elements repressing blue opsin expression in zebrafish UV cones and pineal cells. The Journal of Biological Chemistry, 283: 31625-31632.
(8) Hiramatsu, C., Melin, A. D., Aureli, F., Schaffner, C. M., Vorobyev, M., Matsumoto, Y. and *Kawamura, S. (2008). Importance of achromatic contrast in short-range fruit foraging of primates. PLoS ONE, 3:e3356.
(9) Tsujimura, T., Chinen, A. and *Kawamura, S. (2007). Identification of a locus control region for quadruplicated green-sensitive opsin genes in zebrafish. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 104:12813-12818.
(10) *Melin, A. D., Fedigan, L. M., Hiramatsu, C., Sendall, C. and *Kawamura, S. (2007). Effects of colour vision phenotype on insect capture by a free-ranging population of white-faced capuchins (Cebus capucinus). Animal Behaviour, 73: 205-214.
(11) Matsumoto, Y., Fukamachi, S., Mitani, H. and *Kawamura, S. (2006). Functional characterization of visual opsin repertoire in Medaka (Oryzias latipes). Gene, 371: 268-278.
(12) Hiramatsu, C., Tsutsui, T., Matsumoto, Y., Aureli, F., Fedigan, L. M. and *Kawamura, S. (2005). Color vision polymorphism in wild capuchins (Cebus capucinus) and spider monkeys (Ateles geoffroyi) in Costa Rica. American Journal of Primatology, 67: 447 - 461.
(13) *Saito, A., *Mikami, A., *Kawamura, S., Ueno, Y., Hiramatsu, C., Widayati, K. A., Suryobroto, B., Teramoto, M., Mori, Y., Nagano, K., Fujita K., Kuroshima, H. and Hasegawa, T. (2005). Advantage of dichromats over trichromats in discrimination of color-camouflaged stimuli in non-human primates. American Journal of Primatology, 67: 425 - 436.
(14) Chinen, A., Matsumoto, Y. and *Kawamura, S* (2005). Reconstitution of ancestral green visual pigments of zebrafish and molecular mechanism of their spectral differentiation. Molecular Biology and Evolution, 22:1001-1010.
(15) Takechi, M. and *Kawamura, S. (2005). Temporal and spatial changes in the expression pattern of multiple red and green subtype opsin genes during zebrafish development. The Journal of Experimental Biology, 208:1337-1345.
(16) Chinen, A., Matsumoto, Y. and *Kawamura, S. (2005). Spectral differentiation of blue opsins between phylogenetically close but ecologically distant goldfish and zebrafish. The Journal of Biological Chemistry, 280:9460-9466.
(17) Hiramatsu, C., Radlwimmer, F. B., Yokoyama, S. and *Kawamura S. (2004). Mutagenesis and reconstitution of middle-to-long-wave-sensitive visual pigments of New World monkeys for testing the tuning effect of residues at sites 229 and 233. Vision Research, 44:2225-2231.
(18) *Kawamura, S. and Kubotera, N. (2004). Ancestral loss of short wave-sensitive cone visual pigment in lorisiform prosimians, contrasting with its strict conservation in other prosimians. Journal of Molecular Evolution, 58:314-321.
(19) Chinen, A., Hamaoka, T., Yamada, Y. and *Kawamura, S. (2003). Gene duplication and spectral diversification of cone visual pigments of zebrafish. Genetics, 163:663-675.
<代表的総説>
(20) *河村正二 (2012). 視覚センサー遺伝子の適応と進化多様性:魚類から霊長類まで. 化学と生物, 50: 325-336.
(21) *Kawamura, S., Hiramatsu, C., Melin, A. D., Schaffner, C. M, Aureli, F. and Fedigan, L. M. (2012). Polymorphic color vision in primates: evolutionary considerations. In: Post-Genome Biology of Primates (Hirai, H., Imai, H. and Go, Y. eds.), pp. 93-120, Springer, Tokyo.
(22) *Kawamura, S. (2011). Evolutionary diversification of visual opsin genes in fish and primates. In: From Genes to Animal Behavior: Social Structures, Personalities, Communication by Color (Inoue-Murayama, M., Kawamura, S. and Weiss, A. eds.), pp. 329-349, Springer, Tokyo.
その他
<所属学会>
日本人類学会、日本霊長類学会、日本遺伝学会、日本進化学会、日本動物学会、日本比較生理生化学会、日本分子生物学会、Society for Molecular Biology and Evolution、International Primatological Society
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将来計画
近年、ヒトの集団内及び集団間の遺伝的多様性がゲノムスケールで急速に明らかにされつつあります。また、多種多様な生命の複雑な相互作用からなる環境/生態上のバランスが人類の生存にとって非常に重要であることが一般に認知されてきました。こうした時代背景を踏まえ、進化学的視点に立って遺伝子と生態に関する知見を統合することで、全地球的な生態系の一員として、ヒトという生物種を理解し直す必要が生じてきました。(主に) 非モデル生物の野生集団における遺伝的多様性とその生態への関連性を明らかにしていくことは、現在のヒトの遺伝的多様性の進化学的意義を再評価する上で必須の情報となります。ゲノム配列が決定された種の数は急速に増加しており、この豊富なデータを活用することで、ゲノムワイドに遺伝的変異の機能上の差異を評価する道が拓かれつつあります。視覚をはじめとする感覚系遺伝子の進化多様性の研究は近年の機能解析系の発展を背景としてその研究モデルとして大変優れています。 こうした問題意識の下に、私たちは分子生物学(集団DNA配列決定、遺伝子発現解析、in vitro 機能アッセイ etc.)、生化学、集団遺伝学、分子進化学、行動生態学にまたがる学際的アプローチによって、感覚系遺伝子の進化生態遺伝学トを追求しています。
教員からのメッセージ
マイクロピペッターを使った実験、双眼鏡を使った野外観察、数式を使った理論解析・・・、一見全く違うアプローチですが同じ問題意識から出発しています。必要に応じて多様なアプローチを取り入れるのが進化学の醍醐味でもあります。一緒にチャレンジしませんか。
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