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有田 正規 ありた まさのり/准教授/情報生命科学専攻
情報生命科学専攻 /バイオシステム科学講座/代謝データベース
http://www.metabolome.jp/

略歴
1994年 東京大学理学部情報科学科卒業
1999年 東京大学大学院理学系研究科情報科学専攻満期退学(同年博士(理))
1999年 通商産業省工業技術院電子技術総合研究所研究員
2001年 経済産業省産業技術総合研究所生命情報科学研究センター研究員
2003年 東京大学大学院新領域創成科学研究科情報生命科学専攻准教授
2004年 慶應義塾大学先端生命科学研究所特別研究准教授兼任
2006年 理化学研究所植物科学研究センターメタボローム基盤研究グループ副グループディレクター兼任
教育活動
大学院:情報生命科学基礎I,演習
理学部学部教育プログラム:システム生物学
農学部アグリバイオインフォマティクス:システム生物学
研究活動
以下のデータベースを作成、運営しています。
代謝の情報を載せる総合サイト http://metabolome.jp/
フラボノイドのデータベース http://metabolome.jp/software/
日本脂質生化学会の公式データベース http://lipidbank.jp/
精密マススペクトルデータベース http://massbank.jp/

また生体ネットワーク解析や酵素反応のデータベースも作成しています。
[文献]
1) Nagasaki, H., Arita, M., Nishizawa, T., Suwa, M. and Gotoh, O "Automated classification of alternative splicing and transcriptional initiation and construction of visual database of classified patterns" Bioinformatics, 22(10) 1211-1216, 2006
2) Arita, M. "The metabolic world of Escherichia coli is not small." Proc Natl Acad Sci USA, 101(6) 1543-1547, 2004
その他
脂質生化学会、バイオインフォマティクス学会、農芸化学会、ACM各会員
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将来計画
複数の生物種を比較できるようなインタラクティブ代謝マップを作成します
教員からのメッセージ
研究には芸術的側面が重要です。流行に流されず、よい視点から、一人で論文を書ける研究者になりましょう。
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