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富田 耕造 とみた こうぞう/教授/生命科学研究系
メディカル情報生命専攻/メディカルサイエンス群/RNA生物学
http://www.park.itc.u-tokyo.ac.jp/rnabiology/

略歴
1993年03月 東京大学 工学部 工業化学科卒
1998年03月 東京大学大学院 工学系研究科 化学生命工学専攻 博士課程修了(工学博士)
1998年04月 東京大学大学院 農学系研究科 共同博士研究員
1998年10月 IBMP du CNRS(仏、Strasbourg)博士研究員
1999年10月 Yale 大学 医学部 (米、New Haven)博士研究員
2000年08月 Washington大学 医学部(米、Seattle)博士研究員
2002年04月 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 研究員、助手
2004年04月 独)産業技術総合研究所 生物機能工学研究部門 研究員
2005年04月 同部門 機能性核酸研究グループ長 (2010年3月)
2007年10月 独)科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業 「RNAと生体機能」さきがけ研究員 兼任 (〜2011年3月)
2010年04月独)産業技術総合研究所 バイオメディカル研究部門 RNAプロセシング研究グループ長 (〜2015年3月)
2015年04月 国立研究開発法人 産業技術総合研究所 バイオメディカル研究部門 RNAプロセシング特別研究チーム長(〜2016年3月)
2016年04月 東京大学大学院新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻 RNA生物学分野 教授

教育活動
大学院:基礎講義U
研究活動
RNAのプロセシングの分子基盤研究
[文献]
1) Yamashita S, *Tomita K : Mechanism of 3′-matured tRNA discrimination from 3′-immature tRNA by class-II CCA-adding enzyme.Structure Vol. 24, in press, 2016
2) Yamashita S, Martinez A, *Tomita K : Measurement of acceptor-TPC helix length of tRNA for terminal A76-addition by A-adding enzyme.Structure Vol. 23, No 5, pp830-842, 2015
3) Yamashita S, Takeshita D, *Tomita K : Translocation and rotation of tRNA during template-independent RNA polymerizaion by tRNA nucleotidyltransferase. Structure Vol. 22, No 2, pp315-325, 2014
4) Takeshita D, Yamashita S, *Tomita K: Mechanism for template-independent terminal adenylation activity of Qb replicase.Structure Vol. 20, No 10, pp1661-1669, 2012
5) Takeshita D, *Tomita K: Molecular basis for RNA polymerization by Qb replicase. Nature Structural & Molecular Biology Vol.19, No2, pp229-237, 2012
6) Toh Y, Takeshita D, Nagaike T, Numata T, *Tomita K ::Mechanism for the alternation of the substrate specificities of template-independent RNA polymerases.Structure Vol.19, No 2, pp232-243, 2011
7) Takeshita D, *Tomita K: Assembly of Qβ viral RNA polymerase with host translational elongation factors EF-Tu and -Ts. Proc Natl Acad Sci U S A. Vol. 107, No 36, pp15733-15738, 2010
8) Toh Y, Takeshita D, Numata T, Fukai S, Nureki O, *Tomita K : Mechanism for the definition of elongation and termination by the class II CCA-adding enzyme. EMBO J. vol. 28, No 21, pp3353-3365, 2009
9) Toh Y, Numata T, Watanabe K, Takeshita D, Nureki O, *Tomita K: Molecular basis for maintenance of fidelity during the CCA-adding reaction by a CCA-adding enzyme. EMBO J. Vol. 27, No 14, pp1944-1952, 2008
10) Watanabe K, Toh Y, Suto K, Shimizu Y, Oka N, Wada T, *Tomita K : Protein-based peptide-bond formation by aminoacyl-tRNA protein transferase. Nature. Vol.449, No 7164, pp867-871, 2007
11) Suto K, Shimizu Y, Watanabe K, Ueda T, Fukai S, Nureki O, *Tomita K: Crystal structures of leucyl/phenylalanyl-tRNA-protein transferase and its complex with an aminoacyl-tRNA analog. EMBO J. Vol.25, No 24, pp5942-50, 2006
12)  *Tomita K, Ishitani R, Fukai S, Nureki O.: Complete crystallographic analysis of the dynamics of CCA sequence addition. Nature. Vol. 443, No 7114, 956-960, 2006
13) Tomita K, Fukai S, Ishitani R, Ueda T, Takeuchi N, Vassylyev DG, Nureki O. Structural basis for template-independent RNA polymerization. Nature. Vol. 430, No 7000, 700-704, 2004
14) Okabe M, Tomita K, Ishitani R, Ishii R, Takeuchi N, Arisaka F, Nureki O, Yokoyama S.
Divergent evolutions of trinucleotide polymerization revealed by an archaeal CCA-adding enzyme structure. EMBO J. Vol. 22, No 21, pp5918-5927, 2003
15) Li F, Xiong Y, Wang J, Cho HD, Tomita K, Weiner AM, Steitz TA.
Crystal structures of the Bacillus stearothermophilus CCA-adding enzyme and its complexes with ATP or CTP. Cell. Vol. 111, No 6, pp815-824, 2002
16) Tomita K, Weiner AM.: Collaboration between CC- and A-adding enzymes to build and repair the3′-terminal CCA of tRNA in Aquifex aeolicus. Science Vol. 294, No 5545, pp1334-1336, 2001
17) Tomita K, Ogawa T, Uozumi T, Watanabe K, Masaki H.: A cytotoxic ribonuclease which specifically cleaves four isoaccepting arginine tRNAs at their anticodon loops. Proc Natl Acad Sci U S A. Vol. 97, No 15, pp8278-8283, 2000
18) Ogawa T, Tomita K, Ueda T, Watanabe K, Uozumi T, Masaki H.: A cytotoxic ribonuclease targeting specific transfer RNA anticodons. Science. Vol. 283, No 5410, pp2097-2100, 1999

その他
日本分子生物学会、日本RNA学会
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将来計画
教員からのメッセージ
生命現象の基盤を明らかにすることを目指しています。
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