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木立 尚孝 きりゅう ひさのり/准教授/生命科学研究系
メディカル情報生命専攻/バイオシステム科学講座/バイオインフォマティクス
https://sites.google.com/edu.k.u-tokyo.ac.jp/kiryulab

略歴
1997年3月 京都大学理学部卒業
1999年3月 東京大学大学院総合文化研究科広域科学専攻相関基礎科学系博士前期課程修了
2002年3月 東京大学大学院総合文化研究科広域科学専攻相関基礎科学系博士後期課程単位取得退学
2003年9月 奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科情報生命科学専攻博士前期課程修了
2004年4月 学位取得(学術、東京大学)
2007年3月 奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科博士情報生命科学専攻後期課程課程修了
2007年3月 学位取得(理学、奈良先端科学技術大学院大学)
1999年4月〜2002年3月 日本学術振興会特別研究員(DC1)
2005年4月〜2009年5月 産業技術総合研究所・生命情報工学研究センター 産総研特別研究員(一号契約職員)
2009年6月〜現在 東京大学大学院・新領域創成科学研究科・情報生命科学専攻・バイオシステム科学講座・機能ゲノミクス解析分野 准教授
教育活動
大学院新領域創成科学研究科情報生命科学専攻:RNA配列解析論
教養課程:生物情報学基礎論I
理学部生物情報科学科:ゲノム配列解析論、生物情報科学演習
研究活動
RNA配列解析
比較ゲノム解析のためのツール開発
哺乳動物の転写制御ネットワークの研究
[文献]
1) Hamada M, Sato K, Kiryu H, Mituyama T, Asai K. "Predictions of RNA secondary structure by combining homologous sequence information." ISMB2009, Bioinformatics 25: i330-i338; doi:10.1093/bioinformatics/btp228 (2009)
2) Hisanori Kiryu, Taishin Kin, and Kiyoshi Asai. "Rfold: an exact algorithm for computing local base pairing probabilities." Bioinformatics, 24: 367-373 (2008)
3) Hisanori Kiryu, Taku Oshima, and Kiyoshi Asai. "Extracting relations between promoter sequences and their strengths from microarray data." Bioinformatics 21: 1062-1068.(2005)
その他
日本バイオインフォマティクス学会
独立行政法人 新エネルギー・産業技術総合開発機構の「機能性RNAプロジェクト」
日本RNA学会
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将来計画
哺乳動物の転写制御ネットワークを解析するツールの開発を行っています。
個体発生や臓器の分化のメカニズムをゲノム配列の統計的なシグナルから解明することが目標です。
教員からのメッセージ
バイオインフォマティクスは、今まさにその揺籃期を抜けようとしています。
バイオインフォマティクスのパワーなくしては解決できない多くの生物学的問題が存在します。
この将来有望な分野に加わることを学生の皆さんにお勧めします。
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